該病的病原菌為唐菖蒲假單胞菌大蔥致病變種(大蔥球莖軟腐病假單胞菌)，為胡蘿卜軟腐歐氏桿菌，屬細菌類。病菌在病殘體和土壤中腐生，是田間的主要侵染源，病菌通過未腐熟的肥料、雨水、灌溉水和種蠅、薊馬等害蟲活動傳播蔓延，細菌從傷口侵入。

1、蔥地選擇高地勢地塊的，含沙量高的土壤最佳，雨水多天氣及時排水；

2、培育種苗期間加強田間管理，強根壯苗；

3、移栽定植時翻整土地，增施有機肥或菌肥，增加土壤有機質和透氣性；

4、及時防治地下害蟲，有效消除土壤中蟲卵及幼蟲，減少蟲害對蔥的危害；

5、實行輪作：和白菜、甘藍、芹菜、胡蘿卜、馬鈴薯、土豆等作物輪作；

6、定期沖施有益菌劑例如枯草芽孢桿菌等，改善土壤環境，降低有害菌數量，減少病源；

7、在發病初期開始淋根保護，噴藥時應注重植株基部噴施。每隔7～10天1次，連用2～3次，具體視病情發展而定。